Jonathan Sandoval, nome completo Jonathan Alexis Sandoval Rojas (25 giugno 1987 a Montevideo), è un calciatore uruguaiano.
Il difensore Sandoval, alto 1,76 metri, è stato nel roster della prima squadra del River Plate Montevideo almeno a partire dall'Apertura 2006. In quel semestre ha disputato una partita nella Primera División. Ha giocato per il club del quartiere montevideano di Prado fino alla Clausura 2008. Nell'Apertura 2008 è stato prestato alla Sud América, allora in seconda divisione, dove ha disputato quattro partite di campionato segnando cinque gol. Successivamente è tornato nella massima divisione uruguaiana e ha giocato 13 partite di campionato (senza segnare gol) per il Cerro Largo FC nella Clausura 2009. Questo perché nel gennaio 2009 aveva firmato un contratto in prestito con il River Plate Montevideo. Dopo aver giocato due partite di campionato e una nella Coppa Sudamericana per il River Plate nell'Apertura dello stesso anno, è passato ai Montevideo Wanderers. A partire dalla Clausura 2011, ha disputato 60 partite nella massima divisione uruguaiana per i Bohemios, segnando otto gol. Nella stagione 2013/14 è stato acquistato dal campione uruguaiano in carica, il Peñarol Montevideo. Per gli Aurinegros ha disputato dieci partite (senza segnare gol) nella Primera División e ha giocato tre partite nella Copa Libertadores e una nella Copa Sudamericana. Nella stagione 2014/15 è stato impiegato undici volte (segna un gol) nella massima divisione uruguaiana e una volta (senza segnare gol) nella Copa Sudamericana 2014. Durante la stagione 2015/16 è stato impiegato in un'altra partita di massima divisione (senza segnare gol), ma ha vinto l'Apertura 2015 con la squadra. All'inizio di gennaio 2016, è passato ai Liverpool Montevideo sempre nella stessa lega. Nella Clausura 2016 ha disputato 15 partite di massima divisione (senza segnare gol). A partire dalla metà di luglio 2016 ha continuato la sua carriera in Argentina con gli Argentinos Juniors. Fino ad ora (al 10 febbraio 2017) è stato impiegato in nove partite della Primera B Nacional argentina e ha segnato due gol.