Jonathan Scherzer (22 luglio 1995) è un calciatore austriaco.
Carriera
Scherzer ha iniziato la sua carriera presso l'SV Spittal/Drau. Successivamente ha giocato negli Stati Uniti con l'Athens United. Da lì si è trasferito in Germania al Borussia Mönchengladbach. Successivamente ha giocato anche per il TSV 1860 Monaco.
Nella stagione 2013/14 si trasferì all'FC Augsburg. Dopo una stagione con la squadra degli Under-19, ha fatto il suo debutto nel luglio 2014 per la squadra di riserva degli Augsburg, quando è stato schierato titolare nella prima giornata della stagione 2014/15 contro il FV Illertissen e poi è stato sostituito da Felix Habersetzer al 72° minuto. Ha segnato il suo primo gol nell'agosto 2014 contro il FC Bayern München II.
Dopo più di 70 apparizioni per la squadra riserve dell'Augsburg, è tornato in Austria nel gennaio 2018, dove si è unito alla squadra di Bundesliga FC Admira Wacker Mödling. Ha fatto il suo debutto in Bundesliga nel febbraio 2018, quando è stato titolare nella giornata 22 della stagione 2017/18 contro il SK Rapid Vienna.
Dopo due anni e mezzo all'Admira, si è trasferito nella stagione 2020/21 alla squadra concorrente del Wolfsberger AC, dove ha firmato un contratto valido fino a giugno 2022.