Karlen Mkrttschjan (armeno Կառլեն Մկրտչյան, inglese Karlen Mkrtchyan, ucraino Карлен Вардкесович Мкртчян Karlen Wardkessowytsch Mkrttschjan; * 25 novembre 1988 a Yerevan, RSS armena, Unione Sovietica) è un ex calciatore armeno.
Associazione
Karlen Mkrttschjan ha iniziato la sua carriera nelle giovanili del FC Pjunik Jerewan. Con la squadra della capitale, che prende il nome dall'uccello mitologico Fenice, il centrocampista difensivo ha fatto il suo debutto nel campionato armeno all'età di 18 anni. Con il Pjunik Jerewan, Mkrttschjan ha vinto più volte il campionato e la coppa, nel 2009 ha addirittura ottenuto la tripletta con la vittoria della Supercoppa. Nel marzo 2011, Mkrttschjan si è trasferito a titolo gratuito al Metalurh Donezk in Ucraina, dove ha firmato per tre stagioni. Nella squadra del Metalurh, sono presenti altri due giocatori provenienti dall'Armenia nella stagione 2011/12; tra cui il brasiliano naturalizzato Marcos Pizzelli e Gevorg Ghazaryan, che si sono trasferiti insieme a Donezk.
Il 30 agosto 2013, Mkrttschjan si trasferì all'Anschi Machatschkala, squadra di prima divisione russa. Nel 2015 giocò per il Tobol Qostanai nella premjer-liga del Kazakistan. Successivamente, tornò all'Anschi Machatschkala per due stagioni e dal 2017 giocò nuovamente per il FC Pjunik Jerewan. È lì che, tre anni dopo, concluse la sua carriera da calciatore attivo.
Squadra nazionale
Karlen Mkrttschjan gioca per la Nazionale di calcio dell'Armenia dal 2008, dopo aver già giocato nelle selezioni Under-21 del suo paese.