Lionel André Michel Charbonnier (25 ottobre 1966 a Poitiers) è un allenatore di calcio e ex calciatore francese. Ha giocato nel ruolo di portiere.
Charbonnier ha giocato per l'AJ Auxerre dal 1987, con cui è diventato campione francese e vincitore della coppa nella stagione 1995/96. Dopo undici stagioni con l'Auxerre, nel 1998 si trasferì ai Glasgow Rangers in Scozia. Nella sua prima stagione (1998/99) vinse il triplete, ovvero campionato, coppa di lega e coppa FA. Nel 2001, Charbonnier si trasferì in Svizzera e giocò per una sola stagione con il FC Losanna, prima di concludere la sua carriera agonistica.
Charbonnier è stato convocato 32 volte nella nazionale francese, ma è sceso in campo solo una volta (nel 1997). Faceva parte anche della squadra francese ai Mondiali del 1998 che si sono tenuti in casa, ed è diventato campione del mondo senza avere disputato alcuna partita.
Dopo la sua carriera attiva, Charbonnier ha iniziato a lavorare come allenatore e manager a partire dal 2002, sia per club che per nazionali.