Milan Rapaić (16 agosto 1973 a Nova Gradiška) è un ex calciatore croato.
La sua carriera professionistica è iniziata nel 1991 con l'Hajduk Split, si è trasferito nel 1996 al Perùgia Calcio e dopo quattro anni è passato in Turchia al Fenerbahçe Istanbul, dove ha ricevuto il soprannome RAP-RAP. Dopo un anno senza successo in Italia con la squadra retrocessa dell'AC Ancona, Rapaić è tornato in Croazia. Successivamente ha giocato per tre anni con il club belga Standard Liegi. Nella primavera del 2008 si è unito alla squadra di seconda divisione croata HNK Trogir. I suoi maggiori successi li ha ottenuti con l'Hajduk Split, dove è stato campione nel 1992, 1994, 1995 e 2004.
La sua prima partita internazionale Rapaić l'ha disputata nel 1994, ma fino al Mondiale del 2002 è stato utilizzato solo 20 volte. Dopo aver segnato il gol della vittoria contro l'Italia al Mondiale in Giappone e Corea del Sud nel 2002, è diventato titolare. Aveva la scelta tra la Croazia e la Serbia (essendo serbo croato), ma ha deciso di giocare per la Croazia.
Rapaić gioca principalmente come centrocampista offensivo o sul lato sinistro, anche se è un attaccante di formazione. È famoso per i suoi spettacolari gol su punizione da lunghe distanze.