René Henriksen (27 agosto 1969 a Glostrup) è un ex calciatore danese.
René Henriksen ha iniziato la sua carriera da professionista nel 1988 con il club danese Akademisk Boldklub. Nel 1999 si trasferì in Grecia al Panathinaikos Atene. Con il Panathinaikos, Henriksen, che giocava nella posizione di difensore centrale, ha vinto il campionato greco e la Coppa nel 2004. Nell'estate del 2005 è tornato all'Akademisk Boldklub, dove ha concluso la sua carriera un anno dopo.
Nella nazionale danese, Henriksen ha disputato 66 partite, è stato capitano della squadra e ha preso parte ai campionati del mondo del 1998 e del 2002, oltre che agli europei del 2000 e del 2004.