Christopher Wernitznig è noto per i suoi numerosi successi nel mondo del calcio. Il suo debutto avviene il 1 agosto 2008 con la squadra del Spittal nella Regionalliga. Successivamente, il 15 agosto 2008, fa il suo esordio nella Coppa. Il 19 settembre 2008 segna il suo primo gol ufficiale con la maglia del Spittal, confermando così il suo talento.
Continua ad aggiungere successi alla sua carriera, il 30 luglio 2010 fa il suo esordio nella squadra del SV Villach, che milita nella Landesliga. Il 14 agosto 2010, l'esordio per la squadra del Villacher. L'11 settembre 2010 segna la sua prima doppietta con il SV Villach, dimostrando la sua abilità nel concludere a rete.
Il 20 marzo 2011 fa il suo esordio nella squadra del FC Wacker Innsbruck II, segnando il suo primo gol il 3 aprile 2011. Successivamente, il 16 aprile 2011, fa il suo esordio nella squadra principale del Wacker Innsbruck, che milita nella Austrian Bundesliga. Il 21 settembre 2011 segna il suo primo gol con il Wacker Innsbruck, confermando la sua capacità nel segnare gol importanti.
Il 26 aprile 2014 raggiunge un traguardo importante, disputando la sua centesima partita con il Wacker Innsbruck. Dopo qualche tempo, il 19 luglio 2014 fa il suo esordio nella squadra del Wolfsberger AC. Il 16 luglio 2015 fa il suo esordio nella fase di qualificazione della Europa League.
Il 24 marzo 2016 esordisce con la squadra del Wolfsberger AC II e successivamente, il 5 maggio 2017, segna il suo primo gol con questa squadra. Il 19 settembre 2019 fa il suo esordio nella fase a gironi della Europa League. Dopo qualche tempo, il 9 ottobre 2021, esordisce nella squadra del WAC Sankt Andrä.
Il suo 250esimo incontro si svolge il 26 ottobre 2021 con il Wolfsberger AC, dimostrando la sua costanza nel campo. Il 15 luglio 2022, fa il suo debutto con la squadra dell'Austria Klagenfurt, segnando il suo primo gol. Il 23 aprile 2023 raggiunge il traguardo delle 350 partite nella Austrian Bundesliga, dimostrando il suo impegno nel calcio a livello professionale.
Christopher Wernitznig, grazie ai suoi successi e alla sua abilità, ha dimostrato di essere un calciatore talentuoso e determinato a raggiungere grandi traguardi nella sua carriera. Il suo contributo alle squadre in cui ha militato è stato fondamentale per il successo delle stesse.