Stephan Klossner (30 maggio 1981) è un arbitro di calcio svizzero e un insegnante di scuola cantonale a Willisau. Ha studiato e si è laureato in biologia presso l'Università di Berna.
Dal 2008 dirige regolarmente partite nella Swiss Football League. Nel 2008 ha diretto le prime partite della Challenge League e il 15 agosto 2010 Klossner ha debuttato nella Super League dirigendo la partita tra FC St. Gallen e Grasshopper Club Zürich (1:2). Dal 2012 è anche arbitro FIFA. Stephan Klossner ha inoltre diretto la prima partita non ufficiale della selezione di calcio del Kosovo contro un membro della FIFA il 5 marzo 2014. Ha diretto il 92º finale di Coppa Svizzera il 25 maggio 2017 allo Stade de Genève tra FC Basel e FC Sion.