Debutto |
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 Germania Sub 15 |
14 anni |
20 Maggio 2014 |
Primo goal internazionale |
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| Germania Sub 15 |
14 anni |
22 Maggio 2014 |
Primo goal ufficiale, Esordio per squadra, Primo goal in squadra, Esordio in categoria |
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 Hertha BSC Sub 17 Bundesliga U17 |
15 anni |
16 Agosto 2014 |
Prima doppietta |
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| Hertha BSC Sub 17 |
15 anni |
2 Maggio 2015 |
Esordio per squadra, Esordio in categoria |
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 Hertha BSC Sub 19A-Junioren Bundesliga |
17 anni |
13 Agosto 2016 |
Primo goal in squadra |
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| Hertha BSC Sub 19 |
17 anni |
20 Agosto 2016 |
Esordio per squadra, Esordio in categoria |
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 Hertha BSC II Regionalliga |
18 anni |
30 Luglio 2017 |
Esordio in categoria |
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 DFB Junioren Pokal |
18 anni |
31 Ottobre 2017 |
50 partite |
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| Hertha BSC Sub 19 |
18 anni |
10 Maggio 2018 |
50 partite |
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| A-Junioren Bundesliga |
18 anni |
16 Maggio 2018 |
Primo goal in squadra |
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| Hertha BSC II |
19 anni |
11 Novembre 2018 |
Esordio in categoria |
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 UEFA Youth League |
19 anni |
19 Febbraio 2019 |
Esordio per squadra, Esordio in categoria |
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 Grecia U21 U21 EC Qualifying |
19 anni |
10 Giugno 2019 |
Esordio per squadra, Esordio in categoria |
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 Stuttgart II Oberliga |
20 anni |
4 Agosto 2019 |
Primo goal in squadra |
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| Stuttgart II |
20 anni |
18 Agosto 2019 |
Esordio per squadra |
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 Energie Cottbus |
22 anni |
21 Agosto 2021 |
Primo goal in squadra |
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| Energie Cottbus |
22 anni |
29 Agosto 2021 |
Primo tripletta |
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| Energie Cottbus |
22 anni |
25 Settembre 2021 |
50 partite |
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| Regionalliga |
22 anni |
16 Ottobre 2021 |
Esordio per squadra, Esordio in categoria |
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 Verl 3. Liga |
23 anni |
7 Agosto 2022 |
Esordio per squadra |
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 Hessen Kassel |
24 anni |
5 Agosto 2023 |
Primo goal in squadra |
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| Hessen Kassel |
24 anni |
12 Agosto 2023 |
Nikos Zografakis ha iniziato la sua carriera calcistica al Hertha BSC Sub 17 il 16 agosto 2014, segnando il suo primo gol internazionale solo due giorni dopo contro la Germania Sub 15 il 22 maggio 2014. Il suo primo gol ufficiale e il suo debutto nella squadra arrivano lo stesso giorno, segnando per il Hertha BSC Sub 17 nella Bundesliga U17.
Zografakis ha continuato a dimostrare il suo talento, segnando la sua prima doppietta per il Hertha BSC Sub 17 il 2 maggio 2015. Successivamente, ha fatto il suo esordio nella squadra Hertha BSC Sub 19, nella A-Junioren Bundesliga il 13 agosto 2016, segnando il suo primo gol con la squadra una settimana dopo, il 20 agosto 2016.
Nel luglio del 2017 ha fatto il suo esordio nella squadra Hertha BSC II, nella Regionalliga, e successivamente ha fatto il suo esordio nel DFB Junioren Pokal il 31 ottobre 2017. Ha raggiunto un traguardo di 50 partite con il Hertha BSC Sub 19 il 10 maggio 2018, e lo ha ripetuto nella A-Junioren Bundesliga solo sei giorni dopo, il 16 maggio 2018.
Nel novembre 2018, Zografakis ha segnato il suo primo gol con il Hertha BSC II. Ha poi fatto il suo esordio nella UEFA Youth League il 19 febbraio 2019. Nel giugno dello stesso anno, ha debuttato nella squadra nazionale greca Under-21 nelle qualificazioni al Campionato Europeo Under-21.
Nel 2019, Zografakis ha iniziato a giocare per lo Stuttgart II nella Oberliga, facendo il suo esordio nel mese di agosto e segnando il suo primo gol per la squadra il 18 agosto. Ha poi cambiato squadra, trasferendosi all'Energie Cottbus il 21 agosto 2021, dove ha segnato il suo primo gol il 29 agosto. La sua prima tripletta è arrivata il 25 settembre 2021 con l'Energie Cottbus. Ha raggiunto un traguardo di 50 partite nella Regionalliga il 16 ottobre 2021.
Nel 2022, Zografakis si è unito al Verl nella 3. Liga, facendo il suo esordio nella squadra il 7 agosto. Nel 2023, ha cambiato club nuovamente, questa volta al Hessen Kassel, dove ha fatto il suo esordio il 5 agosto e segnato il suo primo gol per il club il 12 agosto.
