Sean Cleary (nato il 26 febbraio 1983) è un calciatore proveniente dall'Irlanda del Nord.
Firmò per il Cliftonville dall'Ards nel luglio 2005. Iniziò bene la sua carriera con il Cliftonville, facendo il suo debutto contro il Larne nel luglio 2005 e vincendo il premio di Giocatore del Mese due mesi dopo. Nonostante fosse infortunato per la maggior parte della stagione 2006-07, riuscì comunque a segnare tre gol.
Cleary è stato mandato in prestito all'Armagh City all'inizio della stagione 2007-2008, ma è tornato più tardi nella stagione mentre il Cliftonville cercava di conquistare il titolo della Irish Premier League. Tuttavia, nel luglio 2008 gli è stato ordinato di lasciare il club a seguito di "una violazione della disciplina del club".
Nel settembre 2008 si trasferì a Larne. Nell'agosto 2013 si unì ai Crusaders, segnando una volta in sei presenze prima di essere rilasciato più avanti nella stagione.