Il Bayern Monaco e il Bayer Leverkusen sono stati le squadre dominanti della Bundesliga nella stagione 1999-2000, finendo entrambi a quota 73 punti. Tuttavia, grazie a una differenza reti superiore (+45 contro +38), il Bayern Monaco si è aggiudicato il titolo di campione di Germania. Entrambe le squadre hanno dimostrato grande costanza durante la stagione, vincendo quattro delle ultime cinque partite.
Il terzo posto è stato conquistato dall'Hamburger SV, che ha raccolto 59 punti. La squadra ha avuto alti e bassi durante tutta la stagione, ma è riuscita a mantenere una buona posizione nella classifica finale. Tuttavia, le ultime cinque partite sono state piuttosto altalenanti, con una vittoria, due sconfitte e due pareggi.
Il 1860 Monaco ha raggiunto il quarto posto con 53 punti. Nonostante una differenza reti non particolarmente impressionante (+7), la squadra è riuscita a mantenersi costantemente tra le prime posizioni grazie a una serie di risultati altalenanti nelle ultime cinque partite, con due vittorie, due pareggi e una sconfitta.
Il quinto e il sesto posto sono stati conquistati rispettivamente dal Kaiserslautern e dall'Hertha Berlino. Entrambe le squadre hanno concluso la stagione con 50 punti, ma il Kaiserslautern ha ottenuto una differenza reti negativa (-5) rispetto all'Hertha Berlino (-7), che gli ha permesso di posizionarsi più in alto. Entrambe le squadre hanno avuto alti e bassi nelle ultime cinque partite, accumulando due vittorie, due sconfitte e un pareggio ciascuno.
Altre squadre degne di nota nella classifica finale includono il Wolfsburg al settimo posto con 49 punti, lo Stoccarda all'ottavo posto con 48 punti e il Werder Brema al nono posto con 47 punti. Tutte e tre le squadre hanno dimostrato una buona forma nelle ultime cinque partite, conquistando due vittorie, una sconfitta e due pareggi ciascuna.
Al contrario, il Borussia Dortmund ha avuto una stagione al di sotto delle aspettative, finendo all'undicesimo posto con 40 punti. La squadra ha ottenuto solo una vittoria, due pareggi e due sconfitte nelle ultime cinque partite.
In coda alla classifica si trovano l'Arminia Bielefeld al diciassettesimo posto con 30 punti e l'MSV Duisburg all'ultimo posto con soli 22 punti. Entrambe le squadre hanno avuto una stagione difficile e faticato a trovare risultati positivi nelle ultime cinque partite.
In sintesi, la stagione 1999-2000 della Bundesliga è stata caratterizzata da una feroce battaglia tra il Bayern Monaco e il Bayer Leverkusen per il titolo di campione di Germania, con il Bayern Monaco che alla fine si è aggiudicato la vittoria grazie a una differenza reti migliore. Alcune squadre hanno avuto una stagione altalenante, mentre altre hanno lottato per evitare la retrocessione.